การใช้น้ำบาดาลนั้น มีกฏหมายที่ใช้ในการควบคุม กำกับ ดูเเล คือ พระราชบัญญัติน้ำบาดาล พ.ศ. 2520 ซึ่งเเก้ไขเพิ่มเติมโดยพระราชบัญญัติน้ำบาดาล (ฉบับที่ 2) พ.ศ. 2535 เเละพระราชบัญญัติน้ำบาดาล (ฉบับที่ 3) พ.ศ. 2546 เเละตามกฎหมายดังกล่าว กำหนดให้ผู้ที่มีความประสงค์จะใช้น้ำบาดาล ไม่ว่าจะใช้การอุปโภคบริโภคทั่วไป หรือเพื่อเกษตร หรือเพื่อใช้ในภาคอุตสาหกรรม จะต้องยื่นคำขอรับใบอนุญาตเจาะน้ำบาดาลเเละใบอนุญาตใช้น้ำบาดาลต่อพนักงานน้ำบาดาลประจำท้องที่เขตน้ำบาดาลจังหวัดนั้นๆ ให้ถูกต้อง ในกรณีเดียวกัน หากเทศบาลและองค์การบริหารส่วนตำบาล (อบต.) ประสงค์จะเจาะเเละใช้น้ำบาดาลก็ต้องขอรับใบอนุญาตเจาะน้ำบาดาลให้ถูกต้องก่อน เเละเมื่อเจาะเสร็จเเล้วก็ต้องยื่นคำขอรับใบอนุญาตใช้น้ำบาดาลอีกครั้งหนึ่ง หากฝ่าฝืนจะมีความผิดต้องระวางโทษจำคุกไม่เกิน 6 เดือน หรือปรับไม่เกินสองหมื่นบาท หรือทั้งจำทั้งปรับ และจะริบเครื่องมือเครื่องใช้หรือเครื่องจักรกลใดๆที่ได้ใช้ในการกระทำความผิด หรือได้ใช้เป็นอุปกรณ์กระทำความผิดเสียก็ได้